台湾医师指出，质子治疗是以加速过的高能质子射束释放出大量能量，消灭癌细胞，在病灶周围组织完全没有放射剂量，相较传统的X光放疗对正常组织伤害大幅减少，医疗质量明显提高。

台湾林口长庚成立质子暨放射治疗中心，自2015年9月1日起开设「质子治疗咨询门诊」，开放电话预约挂号，民众于门诊经过医师完整评估后，研拟治疗计划，可望早获得这项先进的医疗方式。质子中心提供台湾及世界各地癌症患者先进准确的放射治疗、人性化的医疗环境以及全方位的专业医疗照护服务。质子中心拥有先进的放射治疗设备，包含有四间质子旋转治疗室及十间新型直线加速器治疗室，预计每年服务约 3,000 位直线加速器治疗病患及 1,500 质子治疗病患。

台湾林口长庚质子暨放射治疗中心表示，质子治疗设备是由质子加速器、射束传导系统、旋转机架系统、剂量监测系统、患者定位系统和控制系统等所构成的庞大设施。

质子治疗可将加速过的高能质子射束引导到癌症病灶区，释放出大量能量，消灭癌细胞，但在病灶区后面则完全没有放射剂量，因此相较传统的X光放射治疗，对病灶周围的正常组织伤害大幅减少，对病人的保护与医疗质量明显提高。

台湾林口长庚质子暨放射治疗中心指出，为能确保治疗安全精确，每位病人进入质子治疗放射疗程前，必须先经过放射肿瘤科医师审慎完整的医疗评估，再依据每位病人的病况与肿瘤形状，研拟一套治疗计划，也就是个人化治疗。治疗计划包含模具制作、仿真定位摄影、计算机治疗疗程规划等，每个计划至少需费时2到3周，由医师与病人讨论之后，才按照计划执行治疗。

从质子中心2015/11/04开幕以来，总计有 3,239 位病人接受质子治疗，其中肝癌治疗为大宗疾病，达总体的四分之一人数。

其他主要治疗的肿瘤依序为：头颈癌（含鼻咽癌）、脑部肿瘤、乳癌、肺癌及胰脏癌

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